У Секретаријату Министарства обављају се послови који су везани за кадровска, финансијска и информатичка питања, усклађивање рада унутрашњих јединица и сарадњу са другим органима, као и други послови из делокруга Секретаријата.
У Секретаријату Министарства образују се следеће уже унутрашње јединице:
- Одељење за правне, кадровске и опште послове;
- Одељење за материјално – финансијске послове.